Protein–RNA interactions for Protein: Q86TB9

PATL1, Protein PAT1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL1Q86TB9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PATL1Q86TB9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL1Q86TB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL1Q86TB9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL1Q86TB9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATL1Q86TB9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL1Q86TB9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL1Q86TB9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL1Q86TB9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL1Q86TB9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL1Q86TB9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL1Q86TB9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL1Q86TB9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL1Q86TB9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms