Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF5Q86SE9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCGF5Q86SE9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF5Q86SE9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCGF5Q86SE9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms