Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEND4Q6ZU67 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BEND4Q6ZU67 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEND4Q6ZU67 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEND4Q6ZU67 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEND4Q6ZU67 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms