Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB35

MTHFD1L, Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1LQ6UB35 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MTHFD1LQ6UB35 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTHFD1LQ6UB35 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MTHFD1LQ6UB35 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTHFD1LQ6UB35 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTHFD1LQ6UB35 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTHFD1LQ6UB35 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTHFD1LQ6UB35 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTHFD1LQ6UB35 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTHFD1LQ6UB35 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTHFD1LQ6UB35 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTHFD1LQ6UB35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTHFD1LQ6UB35 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTHFD1LQ6UB35 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTHFD1LQ6UB35 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTHFD1LQ6UB35 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTHFD1LQ6UB35 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTHFD1LQ6UB35 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTHFD1LQ6UB35 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms