Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNNM4Q6P4Q7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNNM4Q6P4Q7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNNM4Q6P4Q7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNNM4Q6P4Q7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNNM4Q6P4Q7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNNM4Q6P4Q7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNNM4Q6P4Q7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNNM4Q6P4Q7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNNM4Q6P4Q7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNNM4Q6P4Q7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNNM4Q6P4Q7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNNM4Q6P4Q7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNNM4Q6P4Q7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNNM4Q6P4Q7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNNM4Q6P4Q7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNNM4Q6P4Q7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms