Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDE2Q6IQ49 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDE2Q6IQ49 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDE2Q6IQ49 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SDE2Q6IQ49 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDE2Q6IQ49 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms