Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC19Q6DKK2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC19Q6DKK2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC19Q6DKK2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTC19Q6DKK2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms