Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
ZC3H13Q5T200 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ZC3H13Q5T200 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
ZC3H13Q5T200 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ZC3H13Q5T200 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ZC3H13Q5T200 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ZC3H13Q5T200 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ZC3H13Q5T200 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ZC3H13Q5T200 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ZC3H13Q5T200 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ZC3H13Q5T200 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
ZC3H13Q5T200 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ZC3H13Q5T200 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ZC3H13Q5T200 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
ZC3H13Q5T200 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ZC3H13Q5T200 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ZC3H13Q5T200 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ZC3H13Q5T200 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
ZC3H13Q5T200 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ZC3H13Q5T200 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.51■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ZC3H13Q5T200 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ZC3H13Q5T200 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
ZC3H13Q5T200 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
ZC3H13Q5T200 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ZC3H13Q5T200 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
ZC3H13Q5T200 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
ZC3H13Q5T200 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZC3H13Q5T200 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZC3H13Q5T200 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZC3H13Q5T200 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms