Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TTC38Q5R3I4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TTC38Q5R3I4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TTC38Q5R3I4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC38Q5R3I4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC38Q5R3I4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC38Q5R3I4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC38Q5R3I4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC38Q5R3I4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC38Q5R3I4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC38Q5R3I4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC38Q5R3I4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC38Q5R3I4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC38Q5R3I4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC38Q5R3I4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC38Q5R3I4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC38Q5R3I4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC38Q5R3I4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC38Q5R3I4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC38Q5R3I4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC38Q5R3I4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC38Q5R3I4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTC38Q5R3I4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTC38Q5R3I4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTC38Q5R3I4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTC38Q5R3I4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTC38Q5R3I4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTC38Q5R3I4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTC38Q5R3I4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTC38Q5R3I4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTC38Q5R3I4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTC38Q5R3I4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC38Q5R3I4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTC38Q5R3I4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TTC38Q5R3I4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTC38Q5R3I4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTC38Q5R3I4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC38Q5R3I4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC38Q5R3I4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC38Q5R3I4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC38Q5R3I4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC38Q5R3I4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC38Q5R3I4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC38Q5R3I4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC38Q5R3I4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTC38Q5R3I4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC38Q5R3I4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms