Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUW0

KRBOX4, KRAB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX4Q5JUW0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRBOX4Q5JUW0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRBOX4Q5JUW0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRBOX4Q5JUW0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms