Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RTL5Q5HYW3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RTL5Q5HYW3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RTL5Q5HYW3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RTL5Q5HYW3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RTL5Q5HYW3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RTL5Q5HYW3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms