Protein–RNA interactions for Protein: Q53EQ6

TIGD5, Tigger transposable element-derived protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD5Q53EQ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TIGD5Q53EQ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TIGD5Q53EQ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TIGD5Q53EQ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TIGD5Q53EQ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TIGD5Q53EQ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TIGD5Q53EQ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TIGD5Q53EQ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TIGD5Q53EQ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TIGD5Q53EQ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TIGD5Q53EQ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TIGD5Q53EQ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TIGD5Q53EQ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TIGD5Q53EQ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TIGD5Q53EQ6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TIGD5Q53EQ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TIGD5Q53EQ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms