Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GNPTABQ3T906 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GNPTABQ3T906 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GNPTABQ3T906 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GNPTABQ3T906 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GNPTABQ3T906 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GNPTABQ3T906 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GNPTABQ3T906 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GNPTABQ3T906 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GNPTABQ3T906 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GNPTABQ3T906 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GNPTABQ3T906 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GNPTABQ3T906 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GNPTABQ3T906 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GNPTABQ3T906 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms