Protein–RNA interactions for Protein: Q30KR1

DEFB109B, Putative beta-defensin 109B, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB109BQ30KR1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEFB109BQ30KR1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEFB109BQ30KR1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DEFB109BQ30KR1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEFB109BQ30KR1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DEFB109BQ30KR1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEFB109BQ30KR1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEFB109BQ30KR1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEFB109BQ30KR1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEFB109BQ30KR1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms