Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2Q16342 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2Q16342 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD2Q16342 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD2Q16342 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
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