Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SHPRHQ149N8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SHPRHQ149N8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SHPRHQ149N8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SHPRHQ149N8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SHPRHQ149N8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHPRHQ149N8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHPRHQ149N8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHPRHQ149N8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHPRHQ149N8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SHPRHQ149N8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SHPRHQ149N8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SHPRHQ149N8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SHPRHQ149N8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SHPRHQ149N8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SHPRHQ149N8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SHPRHQ149N8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SHPRHQ149N8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SHPRHQ149N8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SHPRHQ149N8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SHPRHQ149N8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SHPRHQ149N8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SHPRHQ149N8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SHPRHQ149N8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SHPRHQ149N8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SHPRHQ149N8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHPRHQ149N8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SHPRHQ149N8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SHPRHQ149N8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SHPRHQ149N8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHPRHQ149N8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHPRHQ149N8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHPRHQ149N8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHPRHQ149N8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SHPRHQ149N8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SHPRHQ149N8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHPRHQ149N8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHPRHQ149N8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SHPRHQ149N8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
SHPRHQ149N8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHPRHQ149N8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHPRHQ149N8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHPRHQ149N8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHPRHQ149N8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SHPRHQ149N8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SHPRHQ149N8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SHPRHQ149N8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SHPRHQ149N8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
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