Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1CQ13936 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA1CQ13936 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1CQ13936 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1CQ13936 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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