Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKP2Q13309 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKP2Q13309 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SKP2Q13309 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKP2Q13309 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKP2Q13309 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKP2Q13309 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SKP2Q13309 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKP2Q13309 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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