Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIGQ13278 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIGQ13278 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIGQ13278 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIGQ13278 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIGQ13278 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIGQ13278 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIGQ13278 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIGQ13278 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIGQ13278 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RIGQ13278 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RIGQ13278 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIGQ13278 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIGQ13278 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIGQ13278 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIGQ13278 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIGQ13278 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIGQ13278 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIGQ13278 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIGQ13278 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIGQ13278 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIGQ13278 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIGQ13278 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIGQ13278 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIGQ13278 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIGQ13278 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIGQ13278 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIGQ13278 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIGQ13278 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RIGQ13278 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIGQ13278 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIGQ13278 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIGQ13278 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIGQ13278 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIGQ13278 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIGQ13278 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RIGQ13278 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIGQ13278 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIGQ13278 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIGQ13278 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIGQ13278 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIGQ13278 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIGQ13278 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIGQ13278 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIGQ13278 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIGQ13278 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIGQ13278 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIGQ13278 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIGQ13278 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIGQ13278 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIGQ13278 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIGQ13278 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIGQ13278 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIGQ13278 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIGQ13278 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIGQ13278 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIGQ13278 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIGQ13278 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIGQ13278 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIGQ13278 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIGQ13278 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIGQ13278 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIGQ13278 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIGQ13278 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIGQ13278 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIGQ13278 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIGQ13278 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIGQ13278 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIGQ13278 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIGQ13278 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIGQ13278 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIGQ13278 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIGQ13278 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIGQ13278 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIGQ13278 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIGQ13278 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIGQ13278 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIGQ13278 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIGQ13278 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIGQ13278 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIGQ13278 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIGQ13278 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIGQ13278 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIGQ13278 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIGQ13278 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIGQ13278 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIGQ13278 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIGQ13278 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIGQ13278 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIGQ13278 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIGQ13278 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIGQ13278 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIGQ13278 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIGQ13278 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIGQ13278 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIGQ13278 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIGQ13278 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIGQ13278 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIGQ13278 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIGQ13278 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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