Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
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