Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFX1Q12986 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFX1Q12986 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFX1Q12986 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFX1Q12986 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFX1Q12986 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFX1Q12986 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFX1Q12986 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms