Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTP4A2Q12974 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTP4A2Q12974 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTP4A2Q12974 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PTP4A2Q12974 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTP4A2Q12974 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms