Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TWF1Q12792 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TWF1Q12792 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TWF1Q12792 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWF1Q12792 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWF1Q12792 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWF1Q12792 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
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