Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C1Q12789 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C1Q12789 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C1Q12789 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C1Q12789 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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