Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCNQ0VAF6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYCNQ0VAF6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCNQ0VAF6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms