Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM27E3Q08E93 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM27E3Q08E93 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM27E3Q08E93 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM27E3Q08E93 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM27E3Q08E93 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM27E3Q08E93 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM27E3Q08E93 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM27E3Q08E93 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM27E3Q08E93 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM27E3Q08E93 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM27E3Q08E93 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM27E3Q08E93 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM27E3Q08E93 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27E3Q08E93 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM27E3Q08E93 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms