Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRP1Q07954 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1Q07954 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1Q07954 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRP1Q07954 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms