Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
UBXN1Q04323 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBXN1Q04323 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBXN1Q04323 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN1Q04323 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
UBXN1Q04323 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
UBXN1Q04323 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBXN1Q04323 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN1Q04323 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN1Q04323 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBXN1Q04323 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBXN1Q04323 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms