Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HDLBPQ00341 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HDLBPQ00341 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HDLBPQ00341 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HDLBPQ00341 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HDLBPQ00341 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HDLBPQ00341 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HDLBPQ00341 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HDLBPQ00341 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HDLBPQ00341 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HDLBPQ00341 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HDLBPQ00341 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HDLBPQ00341 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HDLBPQ00341 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HDLBPQ00341 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HDLBPQ00341 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HDLBPQ00341 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HDLBPQ00341 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HDLBPQ00341 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDLBPQ00341 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDLBPQ00341 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HDLBPQ00341 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HDLBPQ00341 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HDLBPQ00341 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HDLBPQ00341 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
HDLBPQ00341 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HDLBPQ00341 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HDLBPQ00341 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
HDLBPQ00341 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HDLBPQ00341 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HDLBPQ00341 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HDLBPQ00341 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HDLBPQ00341 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HDLBPQ00341 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HDLBPQ00341 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HDLBPQ00341 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HDLBPQ00341 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HDLBPQ00341 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HDLBPQ00341 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms