Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PIP4K2BP78356 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PIP4K2BP78356 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PIP4K2BP78356 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PIP4K2BP78356 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PIP4K2BP78356 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PIP4K2BP78356 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
PIP4K2BP78356 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
PIP4K2BP78356 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PIP4K2BP78356 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PIP4K2BP78356 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PIP4K2BP78356 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PIP4K2BP78356 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PIP4K2BP78356 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PIP4K2BP78356 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PIP4K2BP78356 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PIP4K2BP78356 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PIP4K2BP78356 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PIP4K2BP78356 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PIP4K2BP78356 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PIP4K2BP78356 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PIP4K2BP78356 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PIP4K2BP78356 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PIP4K2BP78356 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PIP4K2BP78356 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PIP4K2BP78356 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PIP4K2BP78356 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PIP4K2BP78356 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PIP4K2BP78356 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PIP4K2BP78356 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PIP4K2BP78356 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PIP4K2BP78356 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PIP4K2BP78356 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PIP4K2BP78356 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PIP4K2BP78356 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PIP4K2BP78356 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
PIP4K2BP78356 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PIP4K2BP78356 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms