Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HERVK_113P63132 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P63132 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HERVK_113P63132 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113P63132 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P63132 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms