Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL23P62829 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL23P62829 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL23P62829 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL23P62829 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL23P62829 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL23P62829 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL23P62829 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL23P62829 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL23P62829 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL23P62829 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL23P62829 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL23P62829 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL23P62829 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23P62829 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23P62829 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23P62829 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23P62829 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23P62829 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23P62829 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL23P62829 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL23P62829 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL23P62829 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL23P62829 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL23P62829 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL23P62829 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL23P62829 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL23P62829 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL23P62829 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL23P62829 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL23P62829 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL23P62829 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL23P62829 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23P62829 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23P62829 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23P62829 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23P62829 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL23P62829 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL23P62829 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL23P62829 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL23P62829 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL23P62829 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL23P62829 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL23P62829 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL23P62829 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL23P62829 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL23P62829 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23P62829 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23P62829 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23P62829 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23P62829 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23P62829 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23P62829 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23P62829 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23P62829 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RPL23P62829 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23P62829 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23P62829 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL23P62829 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23P62829 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23P62829 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23P62829 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23P62829 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23P62829 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23P62829 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL23P62829 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL23P62829 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL23P62829 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23P62829 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23P62829 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23P62829 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23P62829 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23P62829 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23P62829 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23P62829 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL23P62829 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL23P62829 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL23P62829 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL23P62829 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL23P62829 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL23P62829 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL23P62829 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL23P62829 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL23P62829 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL23P62829 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL23P62829 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL23P62829 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL23P62829 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL23P62829 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL23P62829 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23P62829 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23P62829 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23P62829 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23P62829 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL23P62829 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL23P62829 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL23P62829 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL23P62829 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL23P62829 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL23P62829 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms