Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM3P62310 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM3P62310 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM3P62310 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM3P62310 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM3P62310 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM3P62310 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM3P62310 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM3P62310 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM3P62310 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM3P62310 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM3P62310 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM3P62310 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM3P62310 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM3P62310 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM3P62310 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM3P62310 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM3P62310 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM3P62310 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM3P62310 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM3P62310 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM3P62310 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM3P62310 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM3P62310 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM3P62310 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM3P62310 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM3P62310 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM3P62310 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM3P62310 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM3P62310 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM3P62310 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM3P62310 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM3P62310 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM3P62310 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM3P62310 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM3P62310 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM3P62310 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM3P62310 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM3P62310 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM3P62310 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM3P62310 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM3P62310 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM3P62310 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM3P62310 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM3P62310 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM3P62310 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM3P62310 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM3P62310 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM3P62310 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM3P62310 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM3P62310 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM3P62310 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM3P62310 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM3P62310 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM3P62310 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM3P62310 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM3P62310 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM3P62310 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM3P62310 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM3P62310 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM3P62310 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM3P62310 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM3P62310 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM3P62310 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM3P62310 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM3P62310 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM3P62310 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM3P62310 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM3P62310 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM3P62310 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM3P62310 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM3P62310 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM3P62310 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM3P62310 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM3P62310 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSM3P62310 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSM3P62310 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSM3P62310 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM3P62310 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSM3P62310 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM3P62310 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM3P62310 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM3P62310 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSM3P62310 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSM3P62310 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM3P62310 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM3P62310 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSM3P62310 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM3P62310 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM3P62310 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSM3P62310 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM3P62310 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSM3P62310 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM3P62310 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM3P62310 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM3P62310 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM3P62310 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM3P62310 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM3P62310 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM3P62310 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms