Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00205P59089 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00205P59089 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00205P59089 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00205P59089 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00205P59089 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms