Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
AFDNP55196 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
AFDNP55196 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
AFDNP55196 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
AFDNP55196 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
AFDNP55196 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
AFDNP55196 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
AFDNP55196 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
AFDNP55196 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
AFDNP55196 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
AFDNP55196 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
AFDNP55196 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
AFDNP55196 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
AFDNP55196 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
AFDNP55196 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
AFDNP55196 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
AFDNP55196 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
AFDNP55196 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
AFDNP55196 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
AFDNP55196 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
AFDNP55196 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
AFDNP55196 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
AFDNP55196 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
AFDNP55196 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
AFDNP55196 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
AFDNP55196 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
AFDNP55196 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
AFDNP55196 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
AFDNP55196 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
AFDNP55196 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
AFDNP55196 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
AFDNP55196 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
AFDNP55196 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
AFDNP55196 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
AFDNP55196 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
AFDNP55196 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
AFDNP55196 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
AFDNP55196 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
AFDNP55196 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
AFDNP55196 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
AFDNP55196 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
AFDNP55196 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
AFDNP55196 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
AFDNP55196 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
AFDNP55196 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
AFDNP55196 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
AFDNP55196 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
AFDNP55196 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
AFDNP55196 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
AFDNP55196 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
AFDNP55196 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
AFDNP55196 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
AFDNP55196 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
AFDNP55196 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
AFDNP55196 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
AFDNP55196 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
AFDNP55196 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
AFDNP55196 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
AFDNP55196 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
AFDNP55196 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
AFDNP55196 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
AFDNP55196 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
AFDNP55196 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
AFDNP55196 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
AFDNP55196 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
AFDNP55196 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
AFDNP55196 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
AFDNP55196 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.89
AFDNP55196 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
AFDNP55196 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
AFDNP55196 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
AFDNP55196 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
AFDNP55196 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
AFDNP55196 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
AFDNP55196 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
AFDNP55196 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
AFDNP55196 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
AFDNP55196 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
AFDNP55196 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
AFDNP55196 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
AFDNP55196 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
AFDNP55196 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
AFDNP55196 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
AFDNP55196 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
AFDNP55196 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
AFDNP55196 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
AFDNP55196 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
AFDNP55196 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
AFDNP55196 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
AFDNP55196 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
AFDNP55196 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
AFDNP55196 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
AFDNP55196 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
AFDNP55196 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
AFDNP55196 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
AFDNP55196 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
AFDNP55196 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
AFDNP55196 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
AFDNP55196 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
AFDNP55196 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms