Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HADHBP55084 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HADHBP55084 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HADHBP55084 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HADHBP55084 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HADHBP55084 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HADHBP55084 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HADHBP55084 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HADHBP55084 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HADHBP55084 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HADHBP55084 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HADHBP55084 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HADHBP55084 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HADHBP55084 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HADHBP55084 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HADHBP55084 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HADHBP55084 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HADHBP55084 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HADHBP55084 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HADHBP55084 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HADHBP55084 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HADHBP55084 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HADHBP55084 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HADHBP55084 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HADHBP55084 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HADHBP55084 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HADHBP55084 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HADHBP55084 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HADHBP55084 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HADHBP55084 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HADHBP55084 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HADHBP55084 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HADHBP55084 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HADHBP55084 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HADHBP55084 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HADHBP55084 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HADHBP55084 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HADHBP55084 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HADHBP55084 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HADHBP55084 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HADHBP55084 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HADHBP55084 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HADHBP55084 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HADHBP55084 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HADHBP55084 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HADHBP55084 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HADHBP55084 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HADHBP55084 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HADHBP55084 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HADHBP55084 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HADHBP55084 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HADHBP55084 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HADHBP55084 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HADHBP55084 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HADHBP55084 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HADHBP55084 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HADHBP55084 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HADHBP55084 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HADHBP55084 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HADHBP55084 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HADHBP55084 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HADHBP55084 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HADHBP55084 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HADHBP55084 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HADHBP55084 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HADHBP55084 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HADHBP55084 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HADHBP55084 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HADHBP55084 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HADHBP55084 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HADHBP55084 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HADHBP55084 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HADHBP55084 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HADHBP55084 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HADHBP55084 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HADHBP55084 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HADHBP55084 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HADHBP55084 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HADHBP55084 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HADHBP55084 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HADHBP55084 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
HADHBP55084 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HADHBP55084 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HADHBP55084 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HADHBP55084 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HADHBP55084 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HADHBP55084 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HADHBP55084 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HADHBP55084 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HADHBP55084 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HADHBP55084 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HADHBP55084 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HADHBP55084 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HADHBP55084 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HADHBP55084 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HADHBP55084 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HADHBP55084 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HADHBP55084 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HADHBP55084 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HADHBP55084 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms