Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LBX1P52954 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LBX1P52954 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LBX1P52954 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LBX1P52954 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LBX1P52954 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LBX1P52954 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LBX1P52954 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LBX1P52954 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LBX1P52954 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
LBX1P52954 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LBX1P52954 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LBX1P52954 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LBX1P52954 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LBX1P52954 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LBX1P52954 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LBX1P52954 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LBX1P52954 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LBX1P52954 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LBX1P52954 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LBX1P52954 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LBX1P52954 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LBX1P52954 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LBX1P52954 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LBX1P52954 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LBX1P52954 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
LBX1P52954 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LBX1P52954 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LBX1P52954 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LBX1P52954 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LBX1P52954 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LBX1P52954 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LBX1P52954 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LBX1P52954 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LBX1P52954 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LBX1P52954 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LBX1P52954 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LBX1P52954 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LBX1P52954 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LBX1P52954 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LBX1P52954 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LBX1P52954 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LBX1P52954 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LBX1P52954 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LBX1P52954 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LBX1P52954 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LBX1P52954 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LBX1P52954 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LBX1P52954 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LBX1P52954 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LBX1P52954 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LBX1P52954 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LBX1P52954 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LBX1P52954 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LBX1P52954 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LBX1P52954 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
LBX1P52954 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LBX1P52954 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LBX1P52954 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LBX1P52954 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LBX1P52954 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LBX1P52954 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LBX1P52954 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
LBX1P52954 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LBX1P52954 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LBX1P52954 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LBX1P52954 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LBX1P52954 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LBX1P52954 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LBX1P52954 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LBX1P52954 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LBX1P52954 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LBX1P52954 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LBX1P52954 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LBX1P52954 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LBX1P52954 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LBX1P52954 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LBX1P52954 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LBX1P52954 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LBX1P52954 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LBX1P52954 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LBX1P52954 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LBX1P52954 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LBX1P52954 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LBX1P52954 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LBX1P52954 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LBX1P52954 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LBX1P52954 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LBX1P52954 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LBX1P52954 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
LBX1P52954 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LBX1P52954 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LBX1P52954 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LBX1P52954 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LBX1P52954 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LBX1P52954 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LBX1P52954 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LBX1P52954 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LBX1P52954 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LBX1P52954 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms