Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
APLP1P51693 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
APLP1P51693 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
APLP1P51693 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
APLP1P51693 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
APLP1P51693 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
APLP1P51693 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
APLP1P51693 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
APLP1P51693 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
APLP1P51693 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
APLP1P51693 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
APLP1P51693 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
APLP1P51693 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
APLP1P51693 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
APLP1P51693 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
APLP1P51693 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
APLP1P51693 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
APLP1P51693 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
APLP1P51693 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
APLP1P51693 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
APLP1P51693 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
APLP1P51693 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
APLP1P51693 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
APLP1P51693 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
APLP1P51693 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
APLP1P51693 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
APLP1P51693 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
APLP1P51693 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
APLP1P51693 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
APLP1P51693 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
APLP1P51693 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
APLP1P51693 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
APLP1P51693 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
APLP1P51693 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
APLP1P51693 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
APLP1P51693 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
APLP1P51693 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
APLP1P51693 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
APLP1P51693 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
APLP1P51693 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
APLP1P51693 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
APLP1P51693 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
APLP1P51693 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
APLP1P51693 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
APLP1P51693 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
APLP1P51693 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
APLP1P51693 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
APLP1P51693 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
APLP1P51693 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
APLP1P51693 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
APLP1P51693 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
APLP1P51693 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
APLP1P51693 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
APLP1P51693 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
APLP1P51693 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
APLP1P51693 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
APLP1P51693 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
APLP1P51693 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
APLP1P51693 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
APLP1P51693 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
APLP1P51693 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
APLP1P51693 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
APLP1P51693 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
APLP1P51693 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
APLP1P51693 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
APLP1P51693 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
APLP1P51693 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
APLP1P51693 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
APLP1P51693 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
APLP1P51693 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
APLP1P51693 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
APLP1P51693 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
APLP1P51693 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
APLP1P51693 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
APLP1P51693 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
APLP1P51693 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
APLP1P51693 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
APLP1P51693 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
APLP1P51693 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
APLP1P51693 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
APLP1P51693 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
APLP1P51693 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
APLP1P51693 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
APLP1P51693 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
APLP1P51693 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APLP1P51693 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APLP1P51693 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
APLP1P51693 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
APLP1P51693 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
APLP1P51693 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
APLP1P51693 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
APLP1P51693 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
APLP1P51693 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
APLP1P51693 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APLP1P51693 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
APLP1P51693 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APLP1P51693 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
APLP1P51693 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
APLP1P51693 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
APLP1P51693 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms