Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKCIP41743 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKCIP41743 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKCIP41743 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKCIP41743 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKCIP41743 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKCIP41743 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKCIP41743 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCIP41743 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKCIP41743 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCIP41743 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCIP41743 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCIP41743 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCIP41743 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCIP41743 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCIP41743 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCIP41743 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCIP41743 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCIP41743 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCIP41743 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKCIP41743 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKCIP41743 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKCIP41743 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKCIP41743 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKCIP41743 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKCIP41743 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCIP41743 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCIP41743 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCIP41743 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCIP41743 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKCIP41743 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKCIP41743 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKCIP41743 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms