Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FDFT1P37268 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FDFT1P37268 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FDFT1P37268 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FDFT1P37268 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FDFT1P37268 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms