Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDC27P30260 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDC27P30260 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CDC27P30260 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDC27P30260 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDC27P30260 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDC27P30260 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDC27P30260 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDC27P30260 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDC27P30260 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDC27P30260 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CDC27P30260 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDC27P30260 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CDC27P30260 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CDC27P30260 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CDC27P30260 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CDC27P30260 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CDC27P30260 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
CDC27P30260 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDC27P30260 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDC27P30260 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDC27P30260 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDC27P30260 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDC27P30260 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDC27P30260 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDC27P30260 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDC27P30260 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDC27P30260 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDC27P30260 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDC27P30260 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDC27P30260 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDC27P30260 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDC27P30260 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDC27P30260 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDC27P30260 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDC27P30260 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDC27P30260 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDC27P30260 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDC27P30260 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDC27P30260 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDC27P30260 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDC27P30260 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDC27P30260 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDC27P30260 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDC27P30260 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDC27P30260 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDC27P30260 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDC27P30260 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDC27P30260 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDC27P30260 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDC27P30260 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDC27P30260 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDC27P30260 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDC27P30260 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDC27P30260 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDC27P30260 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDC27P30260 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDC27P30260 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDC27P30260 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDC27P30260 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CDC27P30260 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDC27P30260 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDC27P30260 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDC27P30260 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDC27P30260 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDC27P30260 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDC27P30260 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDC27P30260 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDC27P30260 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDC27P30260 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDC27P30260 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CDC27P30260 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDC27P30260 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDC27P30260 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDC27P30260 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDC27P30260 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDC27P30260 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDC27P30260 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CDC27P30260 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CDC27P30260 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CDC27P30260 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDC27P30260 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDC27P30260 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDC27P30260 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDC27P30260 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDC27P30260 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDC27P30260 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDC27P30260 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CDC27P30260 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CDC27P30260 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDC27P30260 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDC27P30260 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDC27P30260 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDC27P30260 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDC27P30260 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDC27P30260 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDC27P30260 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDC27P30260 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDC27P30260 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDC27P30260 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms