Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALDH4A1P30038 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH4A1P30038 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH4A1P30038 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALDH4A1P30038 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms