Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN6P29350 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN6P29350 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN6P29350 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN6P29350 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN6P29350 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms