Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFYAP23511 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFYAP23511 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFYAP23511 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFYAP23511 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFYAP23511 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFYAP23511 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFYAP23511 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFYAP23511 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFYAP23511 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFYAP23511 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFYAP23511 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFYAP23511 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFYAP23511 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFYAP23511 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFYAP23511 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFYAP23511 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFYAP23511 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFYAP23511 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFYAP23511 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFYAP23511 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFYAP23511 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFYAP23511 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFYAP23511 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFYAP23511 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFYAP23511 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFYAP23511 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFYAP23511 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFYAP23511 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFYAP23511 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFYAP23511 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFYAP23511 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFYAP23511 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFYAP23511 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFYAP23511 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFYAP23511 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFYAP23511 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFYAP23511 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFYAP23511 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFYAP23511 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFYAP23511 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFYAP23511 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFYAP23511 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFYAP23511 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NFYAP23511 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFYAP23511 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFYAP23511 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFYAP23511 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFYAP23511 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFYAP23511 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFYAP23511 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFYAP23511 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFYAP23511 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFYAP23511 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFYAP23511 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFYAP23511 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFYAP23511 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFYAP23511 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFYAP23511 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFYAP23511 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFYAP23511 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFYAP23511 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFYAP23511 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFYAP23511 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFYAP23511 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFYAP23511 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFYAP23511 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFYAP23511 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFYAP23511 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NFYAP23511 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFYAP23511 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFYAP23511 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFYAP23511 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFYAP23511 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFYAP23511 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFYAP23511 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFYAP23511 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFYAP23511 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFYAP23511 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFYAP23511 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFYAP23511 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFYAP23511 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFYAP23511 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFYAP23511 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFYAP23511 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFYAP23511 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFYAP23511 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NFYAP23511 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFYAP23511 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFYAP23511 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFYAP23511 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFYAP23511 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFYAP23511 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFYAP23511 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFYAP23511 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFYAP23511 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFYAP23511 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFYAP23511 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFYAP23511 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFYAP23511 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms