Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGFR4P22455 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FGFR4P22455 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGFR4P22455 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FGFR4P22455 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGFR4P22455 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGFR4P22455 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FGFR4P22455 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGFR4P22455 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGFR4P22455 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGFR4P22455 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGFR4P22455 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGFR4P22455 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGFR4P22455 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGFR4P22455 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FGFR4P22455 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGFR4P22455 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGFR4P22455 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms