Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMT1P22061 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCMT1P22061 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCMT1P22061 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCMT1P22061 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms