Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NELFEP18615 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFEP18615 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFEP18615 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFEP18615 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELFEP18615 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELFEP18615 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELFEP18615 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFEP18615 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFEP18615 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFEP18615 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFEP18615 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFEP18615 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFEP18615 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFEP18615 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFEP18615 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFEP18615 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFEP18615 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFEP18615 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFEP18615 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFEP18615 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFEP18615 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NELFEP18615 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NELFEP18615 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NELFEP18615 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELFEP18615 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELFEP18615 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFEP18615 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFEP18615 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFEP18615 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFEP18615 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFEP18615 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFEP18615 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NELFEP18615 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFEP18615 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFEP18615 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFEP18615 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFEP18615 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFEP18615 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFEP18615 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFEP18615 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFEP18615 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFEP18615 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFEP18615 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFEP18615 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFEP18615 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFEP18615 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELFEP18615 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELFEP18615 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELFEP18615 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFEP18615 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFEP18615 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFEP18615 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFEP18615 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NELFEP18615 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELFEP18615 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELFEP18615 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFEP18615 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFEP18615 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFEP18615 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NELFEP18615 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFEP18615 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFEP18615 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFEP18615 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFEP18615 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFEP18615 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFEP18615 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFEP18615 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFEP18615 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFEP18615 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFEP18615 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFEP18615 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFEP18615 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFEP18615 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFEP18615 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELFEP18615 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELFEP18615 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NELFEP18615 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFEP18615 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFEP18615 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELFEP18615 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELFEP18615 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFEP18615 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFEP18615 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFEP18615 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFEP18615 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFEP18615 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFEP18615 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFEP18615 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFEP18615 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFEP18615 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFEP18615 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFEP18615 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms