Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAPN2P17655 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAPN2P17655 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAPN2P17655 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAPN2P17655 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAPN2P17655 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CAPN2P17655 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAPN2P17655 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAPN2P17655 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPN2P17655 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN2P17655 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAPN2P17655 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPN2P17655 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPN2P17655 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAPN2P17655 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPN2P17655 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPN2P17655 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPN2P17655 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPN2P17655 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPN2P17655 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPN2P17655 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPN2P17655 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms