Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF28P17035 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF28P17035 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF28P17035 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF28P17035 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF28P17035 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF28P17035 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF28P17035 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms