Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXB2P14652 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB2P14652 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB2P14652 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB2P14652 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB2P14652 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB2P14652 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB2P14652 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB2P14652 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB2P14652 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB2P14652 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXB2P14652 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB2P14652 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXB2P14652 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB2P14652 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB2P14652 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms